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Genomnis (Marseille) : des logiciels d’intelligence artificielle pour la génétique médicale

par Caroline Albenois
25 septembre 2018 at 22h11 (Updated on 18 juillet 2019 at 16h39)
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Genomnis (Marseille) acquiert la licence d’exploitation de logiciels d’intelligence artificielle appliquée à la génétique médicale

 

La SATT Sud-Est concède à la start-up marseillaise Genomnis, basée à Marseille, une licence d’exploitation exclusive sur des logiciels innovants de prédiction de la pathogénicité des mutations du génome humain. La licence porte sur deux logiciels détenus en copropriété entre Aix-Marseille Université, l’Inserm et l’AP-HM. Car la génétique médicale a radicalement changé avec l’émergence du séquençage de nouvelle génération : il est maintenant possible de séquencer des génomes individuels en quelques heures. Le défi n’est plus de générer les données mais d’identifier efficacement les mutations pathogènes dans un océan de données non annotées.

 

L’innovation – une solution bio-informatique de prédiction de la pathogénicité des mutations – est issue des résultats de recherche de l’équipe de génétique et bio-informatique du centre de génétique médicale de Marseille et de l’AP-HM. Elle associe bio-informatique et génomique médicale, et capitalise sur les logiciels « UMD-Predictor » et « Human Splicing Finder » qui permettent de prédire le caractère pathogène des mutations exoniques et introniques dans le cadre du séquençage à haut débit. Les algorithmes développés utilisent une approche combinatoire originale permettant une analyse très rapide, très sensible et spécifique qui surpasse les autres prédicteurs sur le marché.

 

C’est la SATT Sud-Est qui a assuré l’enregistrement des logiciels auprès de l’Agence pour la Protection des Programmes, et qui a négocié et concédé la licence à Genomnis. La start-up est accompagnée et financée par l’Incubateur Interuniversitaire Impulse.

GenOmnis se positionne sur un marché conséquent et en croissance ; principalement les services génomiques et la bio-informatique liée à la génomique, les tests génétiques et la génétique moléculaire en cancérologie. Ses clients sont les hôpitaux et cliniques, les laboratoires de diagnostic et les acteurs de l’industrie pharmaceutique. Genomnis constitue ainsi le pont entre la recherche académique et la recherche industrielle en proposant à cette dernière les logiciels «UMD-Predictor » et « Human Splicing Finder », deux outils mondialement reconnus au niveau académique et répondant à un besoin industriel.

      

 

Caroline Albenois

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